Год спустя после победы на Национальном турнире по Ганпла Баттлу команда «Трай Файтерс» получает приглашение от корпорации «Ядзима Трейдинг» отправиться на удалённый остров для испытания новой боевой системы. Сэкай Камики и Фумина Хошино прибывают на место и с удивлением узнают, что туда же приглашены Гянко, Шиа Киджима и Минато Сакай. Юма Косака сначала отказывается, чтобы помочь Мирай Камики с фотосессией, однако вскоре понимает, что оказался на том же острове вместе с товарищами по команде. Тем временем в лаборатории Нильса Нильсена начинается странная аномалия: новые частицы Плавски собираются в гигантский кристалл, и под его влиянием Ганпла на острове выходит из-под контроля. Боевым командам предстоит объединить усилия, чтобы остановить кристалл до того, как он вызовет хаос во всех системах Ганпла Баттл по всему миру.
