В 2025 году внезапно появляются загадочные механизмы, получившие название Кико, и они начинают нападать на людей, оставляя после себя полностью разрушенные города. Человеческая цивилизация оказывается на грани исчезновения, однако в Японии удаётся найти обломки одного из Кико. Чтобы изучить их вооружение, создаётся научно-исследовательский центр «Токийский институт Кико» (Токиген). Придерживаясь поговорки «клин клином вышибают», человечество возлагает последние надежды на то, чтобы обратить силу Кико против их же создателей. Спустя девять лет благодаря проводимым исследованиям рождается новое оружие под названием «Муцу», чьи боевые возможности почти готовы к применению. Управлять этим механизмом доверяют юноше Рину Сагами и девушке Юдзуру Мидо. На их плечи ляжет бремя надежд всего человечества, но они принимают эту миссию с отвагой и решимостью. Однако впереди их ждёт суровая судьба: путь окажется заполнен испытаниями и жестокими испытаниями, которые поставят под вопрос сами основы выживания человека.
