Событие разворачивается в 0096 году вселенской эры, спустя три года после событий «Мобильного воинa Гандам: Ответный удар Чара» и за 27 лет до начала истории «Мобильного воинa Гандам Эф-91». Главный герой — Банаджер Линкс, студент Академии Анахайм, который неожиданно оказывается втянутым в противостояние Земной Федерации и радикальной группировки The Sleeved. Развязка сюжета вращается вокруг обладания загадочным «Ящиком Лапласа» — артефактом, вокруг которого ходят легенды и слухи о способности радикально изменить ход развития человечества. По мере развития истории Банаджер всё глубже погружается в противостояние сил, чьи интересы скрываются за интригами внутри Федерации и за лицами тех, кто носит маску террористов. Всё начинается в тот день, когда Банаджер встречает Одри Берн, и эта встреча становится отправной точкой для цепи событий, которые захватят его, друзей и врагов в опасной игре, где каждый выбор влияет на будущее всего человечества.
