Сё и его школьный друг Тэцуро Сэгава случайно наталкиваются в лесу на загадочный, сияющий шарообразный механизм — Гайвер Юнит. Неожиданно устройство сливается с Сё, превращая его в инопланетного воина, наделённого таинственной силой и чужим сознанием. Так начинается его новая роль: защитника Гайвер Юнит и носителя редкого артефакта, которому угрожает могущественная японская корпорация «Хронос», охотящаяся за ним и двумя такими же устройствами. Чтобы заполучить силу, компания направляет на их след жестоких монстров — зооноидов, созданных для поимки и разрушения. Жизнь Сё после знакомства с Гайвером перестаёт быть спокойной: нигде больше не существует безопасного уголка — даже он сам не хозяин своему телу. В борьбе за свободу и контроль над силой ему придется столкнуться с многочисленными угрозами, тайнами происхождения устройства и вопросом, кем он может стать в мире, где границы между человеком и инопланетным воином стираются.
