Эта история рассказывает о юноше Такаси Нацумэ, который унаследовал от бабушки Рэйко Нацумэ способность видеть духов. Этот дар не приносил ему радости: духи часто тревожили его и приносили множество неприятностей. Всё меняется, когда Такаси находит у бабушки таинственную «Тетрадь дружбы». Теперь он понимает, зачем духи всё время его преследовали — как добрые, так и злые — и как их влияние формировало его жизнь. Осознав истинное предназначение книги, Такаси вместе со своим телохранителем, могущественным духом по имени Мадарa (斑), начинает помогать прочим духам освободиться от контрактов с Рэйко. Вместе они путешествуют по миру духов, встречая как дружелюбных, так и опасных существ, и учатся устанавливать границы между двумя измерениями. Юноша открывает для себя, что дружба и взаимопомощь могут возникнуть там, где ранее царило недоверие, и что сила истории способна менять судьбы целых миров.
