Шидо Ицука — обычный старшеклассник без заметных примет. В последние дни весенних каникул его родной город рушится под мощным взрывом, и из пепла неожиданно появляется девушка, закованная в доспехи. Привыкнув прийти в себя, он узнаёт от своей старшей сестры Котори, что эта незнакомка — дух, вызвавший пространственно-временные расстройства. Котори объясняет, что возглавляет загадочную организацию под названием «Рататоск», и её задача — предотвратить гибель человечества из‑за действий духов. Но самым странным и рискованным планом становится попытка наладить отношения с духом, чтобы остановить катастрофу. Так ответственность за судьбу мира ложится на плечи Шидо, и единственным напутствием, которое он получает, оказывается фраза сестры, звучащая как каламбур: «Я не прошу тебя победить духа — просто сделай так, чтобы она полюбила тебя, и humanity будет спасено».
