Ещё ребёнком Сиро Эмия теряет родителей в загадочном и разрушительном пожаре. Его удаётся спасти, а затем принять в свою семью — Кирицугу Эмия, уверяющий, что он маг. Из разговоров близких Сиро узнаёт о попытке отца стать «Героем справедливости» — защитником людей, оберегающим слабых и невинных. Воодушевлённый идеалами Кирицугу, Сиро мечтает посвятить себя помощи другим и просит у приёмного отца обучить его магическому искусству, но оказывается неспособным освоить большинство базовых школ колдовства. Однажды Сиро становится свидетелем дуэли между двумя невероятно могущественными магами и нечаянно вызывает девушку в сияющих доспехах, чтобы та защитила его. Позже он узнаёт, что этот конфликт — часть Великой Войны за Святой Грааль, состязания между семью могущественными волшебниками. Маги призывают героических духов древности, известных как Слуги, чтобы те сражались за владельца реликвии, исполняющей желания — Святой Грааль. История следует за Сиро, его непростым положением в войне и его личной борьбой за сохранение своих идеалов.
