Действие аниме «Полифоника S» разворачивается на континенте Полифоника, где люди сосуществуют бок о бок с духами, живя в гармонии и взаимном доверии. Их связь скреплена особым даром — божественной музыкой, которую способны сотворить лишь избранные дэнтисты. В центре сюжета — годы учёбы Форона Татары в Академии Божественной Музыки, его стремление овладеть мастерством и найти общий язык с мирами духов. Мы наблюдаем, как Форон и Кортикарте Апa Лагранджес учатся понимать друг друга, открывая новые грани общения между двумя измерениями и умение слышать ту невидимую ноту, которая соединяет их миры. Их путь — это проба дружбы, взаимного уважения и поддержки, когда каждая мелодия становится шепотом доверия. Но даже в этом идиллическом мире не исчезает угроза. Зло принимает форму террористических сил, которые атакуют города, сеют панику и страх, подрывая спокойствие жителей. Чтобы сохранить баланс между людьми и духами, герои вынуждены не только прогрессировать в своём музыкальном даре, но и объединиться против надвигающейся тьмы, найти силы, чтобы противостоять хаосу и защитить мир на континенте Полифоника.
