Сюжет переносит зрителя в эпоху, когда технологии стали неотъемлемой частью повседневности и даже карточные поединки управляются передовыми изобретениями. Главный герой, Юма Цукумо, мечтает стать чемпионом вселенной «Дуэльных монстров», однако пока что он остаётся новичком без прочной тактики и уверенной стратегии. Во время одного поединка против местного чемпиона Рёге Камисиро он неожиданно сталкивается с загадочным призраком без воспоминаний — Астралом. Существо объясняет, что его память расколота на девяносто девять особых карт, которые называют «Номерами». Теперь цель Юмы выходит далеко за рамки простого подъёма по турнирной лестнице: он обязан помочь странному духу вернуть прошлое и разгадать мистерию номеров. По мере схваток мир раскручивается всё громче, каждая дуэль приносит новые загадки и опасности, а технология и магия карт теснее переплетаются с реальностью. В центре истории — упорство героя, верность другу и тайна, скрытая в каждом номере, который Юма должен собрать и вернуть целостной памятью духа.
