Z/X: Код воссоединения

После затяжного конфликта между человечеством и загадочными зексами — существами, что вторглись в наш мир из пяти параллельных реальностей — наступает хрупкое перемирие. Но на кону остаются судьбы целых миров, и теперь они зависят от молодой больной ученицы Адзуми Кагамихары и её непреклонного партнёра-зекса из Голубого Мира по имени Ригель. Чтобы внести вклад в мир и стать сильнее, Адзуми вынуждена поступить в Академию Фудзимисаки — уникальную школу, созданную специально для подготовки пар, состоящих из человека и зекса, к совместной жизни и бою. По прибытии она знакомится с рядом одноклассниц, и вместе они вступают в период напряжённых тренировок за пределами классных кабинетов. В ходе этого пути героини учатся доверять друг другу, оттачивают навыки и строят новые связи, действуя сообща ради сохранения шаткой гармонии между двумя мирами.