Спецвыпуски аниме Чёрный Джек 2003 года представляют историю загадочного японского врача, чьё странствие по разным уголкам планеты превращается в серию необычных медицинских испытаний. Его хирургический дар способен творить чудеса даже там, где остальные видят безнадёжность, и зритель наблюдает за тем, как сложные операции приходят к удачному завершению благодаря тонкому разуму и молниеносной реакции врача. Но столь непривычный стиль работы вызывает немало споров и неприязни: многие в медицинском мире считают, что он переступает границы правил и норм, выставляя ультра-щедрые суммы за свои услуги. В каждом путешествии за спиной героя неизменно идёт его преданная помощница — маленькая Пиноко, которая уверена, что она — его жена, и эта уверенность придаёт их дуэту странную, интригующую динамику. Так в эпизодах разворачиваются человеческие драмы, где цена выбора и границы морали часто ставят под угрозу жизни людей, а непредсказуемость действий доктора заставляет задуматься о самой сути врачебной этики.
