Химавари Хината отправляется в Академию Шиноби с твёрдым намерением стать одной из самых сильных и благородных ниндзя, какой только может быть девушка её возраста. В детстве её спас неизвестный ниндзя, когда она оказалась на краю гибели в обрушившемся самолёте, и с тех пор она мечтает подражать ему и добиться таких же подвигов. Уже в первый день учёбы её ждёт новое знакомство: Хаято Маденокодзи, недавно переведённый в академию учитель, который неожиданно спасает ей жизнь. Однако у Хаято нет ни малейших способностей ниндзя — он выбрал путь наставника ради солидного оклада, который позволил бы ему расплатиться с давним долгом. Тем не менее Химавари замечает на шее у Хаято ту же татуировку, что была у того загадочного ниндзя, спасшего её в детстве. По мере того как они учатся рядом, она начинает ощущать, что между ними скрыто нечто большее, чем простой учитель и ученица, и прошлое, которому они пытаются убежать, не отпускает их.
