После неловкого конфликта на выпускном старшеклассники Дзёгоро Кобато и Юки Осанаи решают начать новую страницу в старшей школе: тихую, незаметную и без лишнего внимания. Они заключают негласное соглашение стать «маленькими гражданами» — теми, кто не высовывается и не провоцирует проблемы. Но их стремление к спокойной жизни сталкивается с реальностью: в школе возникают странности, интриги и загадочные происшествия, которые сами тянут их за собой. Кобато, стараясь держаться в стороне, всё же не может оставить без внимания окружающий мир: его острый ум и внимательность вытаскивают его на следы загадок и расследований. Осанаи, казавшаяся сдержанной и скрытной, явно прячет за холодной внешностью нечто важное, что с каждым новым таинственным событием всё крепче переплетает её судьбу с их общими расследованиями. В этом мире простые школьные задачи переплетаются с тайнами, и молодой дуэт «маленьких граждан» вынужден балансировать между безопасностью и любопытством, чтобы распутать клубок секретов, не потеряв себя на пути.
