С детства Акэно [岬 明乃] и Моэка [知名 もえか] восхищались смелыми женщинами, посвятившими себя морю — теми, кого прозвали «Голубыми русалками», элитной частью военно-морского флота, управляющей боевыми кораблями. В школе они пообещали друг другу посвятить жизнь океану: жить ради моря, охранять его и странствовать по лазурным волнам вселенной воды. Спустя годы они встречаются снова, уже как ученицы морской академии. Им доверяют ответственные роли капитанов своих судов, и им предстоит две недели провести в открытом море, чтобы отточить судоходное мастерство и сплотить вокруг себя команду. Судно «Харэкадзэ», которым командует Акэно, отчаливает в путь, но из–за поломок двигателей задержка заставляет их задержаться. Внезапно на их корабль выходит карательный инструкторский корабль с огнем. Акэно придется проявить смекалку и найти выход из сложной ситуации в свой первый день на посту капитана.
